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Table 1 Results of space-time negative binomial models fit using INLA, for overall models (1) and models including interaction by region (2), Zambia*

From: A methodological framework for the improved use of routine health system data to evaluate national malaria control programs: evidence from Zambia

Characteristic Adjusted model coefficients (IRR, 2 · 5%-97 · 5%)
  Confirmed cases (1) Confirmed cases (2) Total cases (1) Total cases (2)
ITNs per HH (overall) 0 · 73 (0 · 65–0 · 81)   0 · 69 (0 · 62–0 · 76)  
ITNs per HH in low burden   0 · 59 (0 · 51–0 · 68)   0 · 53 (0 · 46–0 · 62)
ITNs per HH in high burden   0 · 94 (0 · 79–1 · 10)   0 · 93 (0 · 79–1 · 10)
Reporting rate Ŧ 0 · 99 (0 · 97–1 · 00) 0 · 98 (0 · 97–1 · 00) 1 · 07 (1 · 05–1 · 09) 1 · 07 (1 · 05–1 · 09)
Testing rate Ŧ 1 · 22 (1 · 19–1 · 25) 1 · 22 (1 · 19–1 · 25) 0 · 87 (0 · 85–0 · 89) 0 · 87 (0 · 85–0 · 89)
Percent of population within 2 hrs of public health facility Ŧ 0 · 77 (0 · 60–0 · 98) 0 · 77 (0 · 61–0 · 97) 0 · 85 (0 · 67–1 · 07) 0 · 84 (0 · 67–1 · 07)
Treatment-seeking rate Ŧ 1 · 03 (0 · 84–1 · 27) 1 · 03 (0 · 85–1 · 26) 1 · 02 (0 · 83–1 · 26) 1 · 03 (0 · 84–1 · 27)
High-burden province (ref: low) 2 · 39 (1 · 27–4 · 52) 2 · 39 (1 · 31–4 · 36) 2 · 08 (1 · 13–3 · 84) 2 · 09 (1 · 13–3 · 85)
IRS Ŧ 1 · 04 (1 · 02–1 · 06) 1 · 05 (1 · 03–1 · 06) 1 · 01 (0 · 99–1 · 02) 1 · 01 (0 · 99–1 · 03)
RFE (2–3 months lag) Ŧ 0 · 99 (0 · 97–1 · 01) 0 · 99 (0 · 98–1 · 01) 0 · 99 (0 · 97–1 · 01) 0 · 99 (0 · 97–1 · 01)
Max temp (2 mo. lag) Ŧ 1 · 02 (1 · 00–1 · 04) 1 · 02 (1 · 00–1 · 04) 1 · 03 (1 · 01–1 · 05) 1 · 03 (1 · 01–1 · 05)
Min temp (2 mo. lag) Ŧ 1 · 01 (0 · 99–1 · 03) 1 · 01 (0 · 99–1 · 03) 1 · 00 (0 · 98–1 · 02) 1 · 00 (0 · 99–1 · 02)
EVI     
<0 · 2 (ref)     
0 · 2–0 · 3 1 · 15 (1 · 08–1 · 21) 1 · 15 (1 · 08–1 · 21) 1 · 12 (1 · 06–1 · 19) 1 · 12 (1 · 06–1 · 19)
0 · 3–0 · 4 1 · 29 (1 · 18–1 · 40) 1 · 29 (1 · 18–1 · 41) 1 · 32 (1 · 21–1 · 44) 1 · 33 (1 · 22–1 · 45)
>0 · 4 1 · 35 (1 · 22–1 · 51) 1 · 36 (1 · 22–1 · 51) 1 · 37 (1 · 23–1 · 52) 1 · 38 (1 · 24–1 · 53)
Year     
2009 (ref)     
2010 1 · 38 (0 · 88–2 · 16) 1 · 41 (0 · 90–2 · 21) 1 · 23 (0 · 80–1 · 90) 1 · 27 (0 · 83–1 · 95)
2011 1 · 89 (0 · 82–4 · 37) 1 · 90 (0 · 83–4 · 36) 1 · 46 (0 · 66–3 · 25) 1 · 47 (0 · 66–3 · 27)
DIC 38241 · 0 38225 · 8 42901 · 9 42878 · 1
N 2592 2592 2592 2592
  1. *models include calendar month dummy covariates Ŧcovariates are standardized so that a one-unit change represents one standard deviation INLA = Integrated Nested Laplace Approximation; IRR = incidence rate ratio; ITNs = insecticide-treated nets; HH = household; IRS = indoor residual spraying; RFE = rainfall estimate; EVI = enhanced vegetation index; DIC = deviance information criterion.